Teren Kopalni Górażdże jest miejscem występowania wielu rzadkich i chronionych gatunków flory i fauny. Wśród występujących tu 24 cennych roślin, są rzadkie i ginące gatunki, w tym chronione, których stanowiska nie mogą zginąć m.in. kilka gatunków storczykowatych: unikatowy kruszczyk drobnolistny, buławnik czerwony, podkolan biały, gnieźnik leśny. Na terenie kopalni rosną też : miodownik melisowaty , jarząb brekinia, lilia złotogłów. Żyją tu prawie wszystkie chronione w naszym kraju gatunki płazów (traszka grzebieniasta) i gadów (gniewosz plamisty) oraz 50 chronionych gatunków ptaków lęgowych (sieweczka rzeczna, łabędź niemy, myszołów, dzięcioł czarny).